A gestão do Museu de Arte Sacra de São Paulo é realizada pela Associação Museu de Arte Sacra de São Paulo – SAMAS, Organização Social sem fins lucrativos, constituída em 2007. Atualmente, o Conselho de Administração da SAMAS é composto pelos seguintes membros:
José Roberto Marcellino dos Santos
Presidente do Conselho de Administração
Dom Devair Araujo da Fonseca
Vice-Presidente do Conselho de Administração
Conselho de Administração
Cônego Severino Martins da Silva Filho
Demósthenes Madureira de Pinho Neto
Dom Carlos Lema Garcia
George Homenco Filho
Guilherme Werner
João Monteiro de Barros Neto
Marcos Arbaitman
Padre José Roberto Abreu de Mattos
Padre Luiz Eduardo Pinheiro Baronto
Regis Oliveira
Ricardo Nogueira do Nascimento
Rosely Cury Sanches
Rosimeire dos Santos
Conselho Fiscal
Jussara Delphino
José Emídio Teixeira
Pe. José João da Silva
Conselho Consultivo
Ary Casagrande Filho – Presidente
Ario Borges Nunes Junior
Beatriz Vicente de Azevedo
Cônego Celso Pedro da Silva
Cristina Ferraz
Francesca Alzati
Francisco P. S. Vicente de Azevedo
Jack Fernando Ribeiro de Luna
Luiz Arena
Marcos Mendonça
Mariangela de Vasconcellos Marino
Pe. Fernando José Carneiro Cardoso
Renato de Almeida Whitaker
Ricardo I. Ohtake
Ricardo Von Brusky
Roberta Maria Rangel
Rodrigo Mindlin Loeb
Silvia Maria da Penha de Aquino
Tito Enrique da Silva Neto
Padre Valeriano Santos Costa
Haron Cohen
